Нет никакой особой магии ни у пегасов, ни у единорогов. Просто они живут в мире кардинально отличном от нашего - мире, который обладает некой 'антропоцентричностью', в смысле 'доброжелательностью' к разумным существам. В таком мире достаточно ударить копытами по стволу яблони, и спелые яблоки сыпяться прямо в расставленные корзины. Или единорогу достаточно правильно сфокусировать свое желание перенестись в другое место - и бабах, она уже там. Конечно недостаточно сказать 'Хочу дворец до неба' и он тут же вырастет из-под земли, этот мир действует по своим законам. В нем например надо менять сезоны и заставлять тучки пролить дождь 'вручную'. Магия дружбы - это использование законов этого мира, когда желания нескольких существ совпадают настолько, что получается синергический эффект. Почему земные пони не летают аки птицы по небу? Да потому что это им не очень надо (наверно, еслибы такой пони захотел летать настолько, что не мог бы жить без этого - у него бы просто выросли крылья). Им гораздо важнее другие вещи, вроде яблочных пирогов. В таком мире кстати технология не нужна, он достиг уже уровня, где желаемый результат достигается без всякой специальной техники. В крайнем случае, если надо добраться до Клаудсдейла, можно одолжить воздушный шар (собраный за два дня каким-нибудь пони с кьютимаркой шарика, и продающимся за 20 бит в лавке "Воздушные шары и одеяла"). Все материальные ресурсы возобновляются и растут буквально под ногами, и гораздо большее значение имеет 'социальный капитал'. Например, Селестия может поднимать солнце потому, что ее понастоящему любят многие ее 'подданые'.
Вот такая головопушка. А как была создана Эквестрия это уже другая история.