Есть такой вариант объяснения:
http://creshosk.deviantart.com/art/Cras ... moodonly=1
Но там какая-то безумная генетика, опирающаяся только на постулат "а почему бы и нет!"
Обычно Доктора не считают отцом Динки. Его считают... эм... сводным отцом. Назовём это так. :) (Не люблю слово "отчим" и не хочу оскорблять им Доктора). А что? Ты считаешь, что мать одиночка не может выйти замуж за кого-то ещё?
Сама Динки, по одному из предположений, может быть приёмной дочерью Дерпи, а по другим предположениям у Динки был отец-единорог, который пропал без вести, а ещё по каким-то предположениям у неё отец-единорог, который никуда не пропадал, и Дерпи, соответственно, не мать-одиночка. Фанаты уже придумали много альтернативных вселенных. Выбирай на свой вкус. :)