Позволю себе сделать пару замечаний.
Прежде всего, в теме звучит "научная фантастика", а набор книжек (DMG, PHB, MM, как я понимаю) вы берёте для сугубо фэнтезийного сеттинга. Есть же d20 Modern, наконец - там заведомо больше полезных цифр, чем в ванильном ДнД 3.5.
Что же касается правил, на правах рекламы предложу перерабатывать вот эту систему. Она, по сути, и есть эрзац-заменитель ДнД 3.5, созданный на этом форуме для одной местной ролёвки. Система обкатывается и дорабатывается с мая прошлого года.