По-моему, между событиями, изображёнными в пьесе и правлением Селестии ещё была пора, когда правил Дискорд. И уже у него Селестия с Луной отвоевали власть при помощи Элементов.
У меня создалось такое впечатление, что основал Эквестрию "простой люд", потом Дискорд пришёл к власти, подчинив себе всех и настроив всех друг против друга, был свергнут, и наступила эра правления Селестии.