Пегасы не летают, они перемещаются в пространстве времени с помощью врожденной магии которая управляется крыльями. (ходят по облакам) Что не требует таких энерго затрат как у птиц и летающих ящеров.
Насчет физиологии, где-то когда-то на просторах интернета проводились очень подробные работы по проектированию скелета, мышц, и сухожилий у летающих драконов. Получилось вроде довольно логично и теоретически возможно, для драконов. Пегасы же физиологически не подходят для этой концепции. Единственное логическое объяснение это использование энергий и техник которым в человеческом мире нет аналогов и которое в простонародье называют магией. =)
Мушруш
Думаю что дело в крыльях, крыльях как источник магии, крылья позволяют телу перемешаться по воздуху. Спать на облаках, делать пагоду и возможно содержат секрет создания радуги, даже в жидком виде. Крылья есть и у грифонов, которая если мне не изменяет память свободно располагалась на облаках соревнуясь с Рэйнбоу-Даш и отбиваясь от Пинкт-Пай.
Говоря об этом можно предположить что крылья имеют не тока физическую структуру но и некую магическую составляющую. Которая возможно позволяет пренебречь различными физическими параметрами. Отсюда можно получить те крылья пегасов которые у них есть. =)
Мушруш
Не тока пегасы пони и единороги были выведены, весь мир создан и управляется великими пони ZOG. =)
Магическим куполом – барьером окружены все города. Искусственная пагода, смена сезонов. Границу барьера очень хорошо видно при в ходе в вечно дикий лес. В котором возможно обитают остальные, сумевшие выжить виды, созданные в ходе экспериментов по созданию пони, ну или магии пони если хотите. Притом существа живущие в вечно диком лису при обычных обстоятельствах неспособны пересечь магический барьер. Этим объясняется отсутствие угрозы со стороны леса.
Что касается самих пони то очень похоже что любая жестокость или любопытство сверх меры пресекаются самым действенным способом, не физическим а психологическим так сказать ментально, навряд ли кто ни будь их жителей вообще может подумать о каких либо серьезных преступлениях. Что приводит к ненужности каких либо правоохранительных органов и военных, стражи есть тока у Селестии и то в качестве отгонял от назойливых простолюдинов. Даже Твайлайт магичка энного уровня неспособна применить какой либо вид боевой магии.
Я виду к тому что если кто-то или что-то решило создать мир пони, грифонов, драконов. То имея определенный уровень технологий (магии) это для него не составит ни какого труда.
Честно говоря весьма резонным посчитать что этот мир и общество создала Селестия, затем чтобы понять что есть дружба там любовь и остальное. Зачем заставлять нашу Твайлайт писать ей отчеты о дружбе, контроль развития необычно сильного мага или собственный интерес?

Ps. Хотя это уже из создания пони вселенной =)
Pss. Не стоит слепо верить официальной науке и истории. =)
Мушруш