Конечно, они изменились. Если брать с S1E1 - то сильнее всего поменялись Твайлайт и Луна. С ними ясно, почему.
Еще поменялась Флаттершай. Она выросла из... Флаттершай (хотя я напомню вам про поход аж до самой библиотеки от простого любопытства, S1E1) до характера круче Рейнбоу Дэш на 46%.
За другими персонажами я роста не заметил, если не считать сотую серию, в котором большая часть пантеона второстепенных богов фоновых пони выросла от уровня обоев до второстепенных персонажей уровня Мэр.