Ну от ума здесь ничего не зависит. Возможно большее понимание Твай объясняется подрасположеностью к этому персонажу. Ведь она серьёзна и логична, можно даже сказать гораздо взрослее чем остальные, а основная часть фанатов МЛП это "мужики".
А вообще говоря о интеллекте, так тут ничего не известно. У каждой пони свой выбор чем заниматься, от куда вам знать глупа ли Эплджек или нет, просто не захотела тратить всё своё время на учёбу, и она больше практики чем теоретик.
Самой одновременно раскрытой и тайной личностью я считаю Флаттэршай. Если повспоминать то ей посвещено или же косвенно посвещено гораздо больше серий чем остальным. И у неё самая глубокая личность, а внутренняя сила духа гораздо больше чем у остальных (ведь даже Дискорд не смог с ней справиться, и сразу применил силу чтоб её изменить). А так же она хорошо разбирается в зоологии, хорошо разбирается в медицине, хорошо разбирается в шитье, и кто ещё знает что она умеет. Например Уильям Джеймс Сидис с IQ в 300 был очень нелюдимым человеком, и когда кто то на работе узнавал что он гений сразу увольнялся. Так что с Флаттэршай всё может быть.