В целом изменение произошли,даже если мы их не замечаем, ведь нельзя войти в одну и ту же реку дважды.
Эта их радужнофикация, можно рассмотреть как явление имеющее похожую природу, что и заклинание Твайлайт в MMC.
Я ведь не случайно выложил скрины с их круглым глазами. Где-то ведь мы их уже видели... и... тогда тоже присутствовало свечение, пусть и одноцветное в цвет конкретного персонажа вокруг всего тела. Ну а теперь, цвета те же, только вместе - типа мы едины.
Пусть это отдает немного фатализмом, но затронута была в тот момент вся вселенная, для того что бы все произошло именно так, а не иначе и события шли в нужном направлении.
P.S. А хитрая Селестия в этот момент спряталась в подпространстве вселенной, что бы избежать воздействия и ждала Твайлайт.