Классно, отличные исследования! Дополню своими соображениями.
Про телекинез. Как, например, люди могут поднимать камень каждый по-своему: сверху, снизу, всей ладонью, пальцами, так и у пони могут быть свои привычки: за центр масс, за несколько точек, поддерживая, полностью охватывая. И теоретически, по таким мелким деталям можно раскрыть обман. Но это опять же детективные наблюдения, а не уникальный тепловой след магии.
Про бризи. Они показаны очень лёгкими насекомыми. Поэтому при превращении пони в бризи непонятно, куда девается лишняя масса. И откуда берётся при обратном превращении. И где хранится, если всё же хранится: внутренней энергии в шести пони хватит не то что лазором пальнуть, а сносить горы до основания.
Про голову. Чейнджлинги могут превращаться во что угодно. Например, и в столь любимое Флаттершай дерево. Так как у дерева головы (и рога) нет, то дальше чейнджлинг либо "тыщу лет живёт баобабом", либо - думают они не головой. А раз так, то голова у них не является жизненно важной частью тела. (Я ввёл "сенсорную систему" - по сути, аналог "души", неосязаемой, но всё ещё материальной (в смысле поля как особого вида материи) мыслящей сущности над уровнем тела.)
Про сталь. Сила железа идёт из славянской мифологии, где всякой нечисти, тёмным силам с Тёмной Звезды противостоят трое светлых братьев-богов: Даждьбог, Перун и Огонь. Соответственно, победить нечисть могут контролируемые ими силы: Солнце, Гроза (электричество) и Огонь (тут фантазии не хватило) соответственно. Железо и сталь как производные огня несут в себе его частицу и являются оберегами, а кузнец - типа защитника.
Против обычного, классического оборотня железо ещё может помочь, но не против няшно-поняшного. Они не тёмные как таковые. А вот против Сомбры может и сработать.