В мультике не один раз можно увидеть, как пони держат копытами инструменты (молотки и т.п.). Так что же помешает им с такой же легкостью взять в копыто перо ?
Можно припомнить Эплблум, поднимающую штангу одним хвостом, состоящим из волос. Так что держанию предметов копытами можно удивляться нужно не сильнее, чем пегасу, спящему на облаке.
Кто то где то высказывал гипотезу, что телекинезом владеют все пони (полеты пегасов с их маленькими крыльями, держание пони предметов копытами и т.п.), однако только единороги способны делать это осознанно. У остальных это происходит на уровне инстинктов, при взаимодействии с предметами.
Это звучит вполне логично, так что не думаю, что письменность - удел избранных, то есть единорогов.
Относительно самой письменности сложно что то сказать. Мы видим то какие то загогулины, то таинственные значки, а иногда и английские буквы. Скорее всего они пользуются буквенным алфавитом, который возможно был модернизирован в процессе развития страны. Этим можно было бы объяснить различия в письменности из древних книг и современных надписях.